Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F4P49335 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms