Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms