Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms