Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB2P29033 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB2P29033 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB2P29033 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB2P29033 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms