Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRGP23470 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
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