Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCL3L1P16619 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL3L1P16619 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL3L1P16619 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL3L1P16619 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL3L1P16619 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL3L1P16619 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL3L1P16619 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCL3L1P16619 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCL3L1P16619 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCL3L1P16619 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL3L1P16619 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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