Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT3P12035 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT3P12035 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT3P12035 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms