Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms