Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E9PBE3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E9PBE3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E9PBE3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms