Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms