Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms