Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms