Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms