Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPZ2Q9P299 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms