Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms