Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23BQ9NYZ1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms