Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms