Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms