Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RAB9BQ9NP90 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RAB9BQ9NP90 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RAB9BQ9NP90 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RAB9BQ9NP90 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RAB9BQ9NP90 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RAB9BQ9NP90 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9BQ9NP90 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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