Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf27Q9GZN8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms