Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms