Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4CQ96DT6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms