Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM41Q8WV44 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM41Q8WV44 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms