Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q499Y3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q499Y3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q499Y3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q499Y3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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