Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FHOD3Q2V2M9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms