Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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