Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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