Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCIRG1Q13488 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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