Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.8 ms