Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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