Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms