Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC10Q01780 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms