Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms