Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms