Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THBS4P35443 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms