Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF4P23510 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF4P23510 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF4P23510 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF4P23510 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF4P23510 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF4P23510 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF4P23510 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF4P23510 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF4P23510 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF4P23510 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms