Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPREP23469 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPREP23469 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPREP23469 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms