Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3BP20337 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms