Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGFO15240 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGFO15240 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGFO15240 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGFO15240 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
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