Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP23O00161 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP23O00161 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP23O00161 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP23O00161 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP23O00161 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNAP23O00161 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms