Protein–RNA interactions for Protein: V9GXZ4

FPGT-TNNI3K, FPGT-TNNI3K readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms