Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA3Q9UL41 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms