Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms