Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSHZ2Q9NRE2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSHZ2Q9NRE2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms