Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPRTQ96BW1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms