Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms