Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms