Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3KQ59H18 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3KQ59H18 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3KQ59H18 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3KQ59H18 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3KQ59H18 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3KQ59H18 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNNI3KQ59H18 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3KQ59H18 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms