Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKOR2Q2VWA4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms