Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MSMPQ1L6U9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MSMPQ1L6U9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MSMPQ1L6U9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MSMPQ1L6U9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MSMPQ1L6U9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSMPQ1L6U9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms